Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRDNQ13061 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRDNQ13061 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRDNQ13061 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
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