Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTP1P59025 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTP1P59025 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP1P59025 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP1P59025 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP1P59025 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP1P59025 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP1P59025 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP1P59025 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTP1P59025 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RTP1P59025 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP1P59025 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP1P59025 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP1P59025 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP1P59025 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP1P59025 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTP1P59025 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP1P59025 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP1P59025 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP1P59025 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP1P59025 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP1P59025 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTP1P59025 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTP1P59025 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTP1P59025 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTP1P59025 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTP1P59025 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTP1P59025 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTP1P59025 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP1P59025 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP1P59025 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP1P59025 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP1P59025 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP1P59025 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP1P59025 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTP1P59025 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTP1P59025 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTP1P59025 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTP1P59025 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTP1P59025 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP1P59025 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP1P59025 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP1P59025 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP1P59025 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP1P59025 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTP1P59025 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP1P59025 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP1P59025 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RTP1P59025 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTP1P59025 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP1P59025 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP1P59025 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP1P59025 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP1P59025 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP1P59025 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTP1P59025 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP1P59025 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP1P59025 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTP1P59025 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTP1P59025 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP1P59025 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP1P59025 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP1P59025 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP1P59025 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms