Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOO75962 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOO75962 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOO75962 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOO75962 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOO75962 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIOO75962 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIOO75962 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIOO75962 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOO75962 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOO75962 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIOO75962 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOO75962 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIOO75962 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOO75962 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOO75962 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOO75962 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOO75962 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOO75962 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOO75962 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOO75962 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIOO75962 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIOO75962 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOO75962 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOO75962 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIOO75962 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOO75962 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOO75962 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOO75962 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOO75962 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOO75962 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOO75962 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIOO75962 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIOO75962 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIOO75962 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIOO75962 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIOO75962 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOO75962 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIOO75962 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIOO75962 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOO75962 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOO75962 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOO75962 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOO75962 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOO75962 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIOO75962 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOO75962 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOO75962 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOO75962 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOO75962 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOO75962 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOO75962 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOO75962 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIOO75962 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOO75962 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOO75962 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOO75962 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOO75962 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIOO75962 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIOO75962 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOO75962 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms