Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRPF40AO75400 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRPF40AO75400 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF40AO75400 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms