Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAD1O00515 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAD1O00515 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAD1O00515 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAD1O00515 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAD1O00515 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAD1O00515 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAD1O00515 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAD1O00515 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAD1O00515 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LAD1O00515 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAD1O00515 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAD1O00515 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAD1O00515 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAD1O00515 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAD1O00515 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAD1O00515 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAD1O00515 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LAD1O00515 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAD1O00515 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAD1O00515 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAD1O00515 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAD1O00515 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAD1O00515 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAD1O00515 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAD1O00515 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAD1O00515 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAD1O00515 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAD1O00515 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAD1O00515 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAD1O00515 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAD1O00515 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAD1O00515 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAD1O00515 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAD1O00515 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAD1O00515 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAD1O00515 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAD1O00515 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAD1O00515 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAD1O00515 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAD1O00515 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAD1O00515 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAD1O00515 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LAD1O00515 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAD1O00515 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAD1O00515 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAD1O00515 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAD1O00515 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAD1O00515 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAD1O00515 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAD1O00515 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAD1O00515 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LAD1O00515 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAD1O00515 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAD1O00515 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAD1O00515 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAD1O00515 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAD1O00515 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAD1O00515 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAD1O00515 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAD1O00515 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAD1O00515 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAD1O00515 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAD1O00515 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAD1O00515 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAD1O00515 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAD1O00515 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAD1O00515 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAD1O00515 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAD1O00515 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms