Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HDAC6Q9UBN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDAC6Q9UBN7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC6Q9UBN7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms