Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZCCHC17Q9NP64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms