Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNHG12Q9BXW3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNHG12Q9BXW3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms