Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC2P3Q9BVR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC2P3Q9BVR0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC2P3Q9BVR0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms