Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGAP3Q96FM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGAP3Q96FM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms