Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC63Q8NA47 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC63Q8NA47 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms