Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LTBP4Q8N2S1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LTBP4Q8N2S1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTBP4Q8N2S1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LTBP4Q8N2S1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms