Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX2Q16385 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSX2Q16385 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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