Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NID2Q14112 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NID2Q14112 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NID2Q14112 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NID2Q14112 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NID2Q14112 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NID2Q14112 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NID2Q14112 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NID2Q14112 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NID2Q14112 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NID2Q14112 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NID2Q14112 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NID2Q14112 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NID2Q14112 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NID2Q14112 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NID2Q14112 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NID2Q14112 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NID2Q14112 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NID2Q14112 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NID2Q14112 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NID2Q14112 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NID2Q14112 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NID2Q14112 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NID2Q14112 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NID2Q14112 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NID2Q14112 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NID2Q14112 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NID2Q14112 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NID2Q14112 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NID2Q14112 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NID2Q14112 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NID2Q14112 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NID2Q14112 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NID2Q14112 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NID2Q14112 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NID2Q14112 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NID2Q14112 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NID2Q14112 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NID2Q14112 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NID2Q14112 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NID2Q14112 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NID2Q14112 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NID2Q14112 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NID2Q14112 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
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NID2Q14112 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NID2Q14112 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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NID2Q14112 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NID2Q14112 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NID2Q14112 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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NID2Q14112 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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NID2Q14112 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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NID2Q14112 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NID2Q14112 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NID2Q14112 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NID2Q14112 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NID2Q14112 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NID2Q14112 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NID2Q14112 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NID2Q14112 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NID2Q14112 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NID2Q14112 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NID2Q14112 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NID2Q14112 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NID2Q14112 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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