Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB3Q12988 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB3Q12988 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms