Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTBN1Q01082 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTBN1Q01082 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTBN1Q01082 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms