Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS13P62277 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS13P62277 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS13P62277 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS13P62277 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS13P62277 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS13P62277 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS13P62277 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS13P62277 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS13P62277 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS13P62277 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS13P62277 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS13P62277 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS13P62277 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS13P62277 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS13P62277 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS13P62277 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS13P62277 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS13P62277 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS13P62277 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS13P62277 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS13P62277 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS13P62277 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS13P62277 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS13P62277 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS13P62277 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS13P62277 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS13P62277 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS13P62277 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS13P62277 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS13P62277 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS13P62277 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS13P62277 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS13P62277 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS13P62277 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS13P62277 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS13P62277 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS13P62277 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS13P62277 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS13P62277 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS13P62277 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS13P62277 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS13P62277 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS13P62277 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS13P62277 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS13P62277 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS13P62277 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS13P62277 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS13P62277 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS13P62277 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS13P62277 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS13P62277 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS13P62277 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS13P62277 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS13P62277 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS13P62277 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS13P62277 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS13P62277 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS13P62277 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS13P62277 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS13P62277 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS13P62277 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS13P62277 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS13P62277 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS13P62277 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS13P62277 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS13P62277 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS13P62277 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS13P62277 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS13P62277 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS13P62277 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS13P62277 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms