Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HDGFP51858 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HDGFP51858 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HDGFP51858 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
HDGFP51858 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HDGFP51858 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HDGFP51858 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
HDGFP51858 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HDGFP51858 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HDGFP51858 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HDGFP51858 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HDGFP51858 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HDGFP51858 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HDGFP51858 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HDGFP51858 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HDGFP51858 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HDGFP51858 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HDGFP51858 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HDGFP51858 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HDGFP51858 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HDGFP51858 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HDGFP51858 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HDGFP51858 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HDGFP51858 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HDGFP51858 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HDGFP51858 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HDGFP51858 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HDGFP51858 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HDGFP51858 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HDGFP51858 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HDGFP51858 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HDGFP51858 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HDGFP51858 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HDGFP51858 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HDGFP51858 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HDGFP51858 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HDGFP51858 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HDGFP51858 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HDGFP51858 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HDGFP51858 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HDGFP51858 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HDGFP51858 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HDGFP51858 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HDGFP51858 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HDGFP51858 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HDGFP51858 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HDGFP51858 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HDGFP51858 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HDGFP51858 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HDGFP51858 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HDGFP51858 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HDGFP51858 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HDGFP51858 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HDGFP51858 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HDGFP51858 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HDGFP51858 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HDGFP51858 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HDGFP51858 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HDGFP51858 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HDGFP51858 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HDGFP51858 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HDGFP51858 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
HDGFP51858 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HDGFP51858 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HDGFP51858 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HDGFP51858 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HDGFP51858 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HDGFP51858 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HDGFP51858 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HDGFP51858 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HDGFP51858 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
HDGFP51858 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
HDGFP51858 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HDGFP51858 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HDGFP51858 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HDGFP51858 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HDGFP51858 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HDGFP51858 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HDGFP51858 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HDGFP51858 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HDGFP51858 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HDGFP51858 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
HDGFP51858 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HDGFP51858 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
HDGFP51858 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HDGFP51858 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HDGFP51858 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HDGFP51858 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
HDGFP51858 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HDGFP51858 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HDGFP51858 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
HDGFP51858 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HDGFP51858 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HDGFP51858 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HDGFP51858 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HDGFP51858 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
HDGFP51858 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HDGFP51858 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HDGFP51858 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HDGFP51858 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms