Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRCA2P51587 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRCA2P51587 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms