Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD8P48556 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms