Protein–RNA interactions for Protein: P11142

HSPA8, Heat shock cognate 71 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA8P11142 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSPA8P11142 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA8P11142 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA8P11142 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA8P11142 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HSPA8P11142 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA8P11142 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA8P11142 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA8P11142 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA8P11142 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA8P11142 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA8P11142 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA8P11142 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA8P11142 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA8P11142 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HSPA8P11142 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA8P11142 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA8P11142 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA8P11142 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA8P11142 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA8P11142 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA8P11142 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA8P11142 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms