Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VIPP01282 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPP01282 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIPP01282 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPP01282 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPP01282 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIPP01282 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPP01282 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPP01282 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPP01282 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPP01282 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIPP01282 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIPP01282 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPP01282 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPP01282 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPP01282 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPP01282 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPP01282 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPP01282 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPP01282 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPP01282 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPP01282 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPP01282 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPP01282 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPP01282 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPP01282 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPP01282 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPP01282 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPP01282 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPP01282 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIPP01282 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIPP01282 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIPP01282 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIPP01282 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPP01282 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPP01282 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPP01282 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPP01282 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPP01282 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPP01282 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPP01282 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPP01282 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPP01282 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPP01282 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPP01282 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPP01282 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPP01282 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPP01282 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPP01282 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPP01282 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPP01282 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms