Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SPAG9O60271 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SPAG9O60271 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SPAG9O60271 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SPAG9O60271 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SPAG9O60271 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SPAG9O60271 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SPAG9O60271 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms