Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms