Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJP4

KLHL21, Kelch-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21Q9UJP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL21Q9UJP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL21Q9UJP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL21Q9UJP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms