Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APEX2Q9UBZ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APEX2Q9UBZ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APEX2Q9UBZ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms