Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPG2Q9UBF2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPG2Q9UBF2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms