Protein–RNA interactions for Protein: Q9H305

CDIP1, Cell death-inducing p53-target protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIP1Q9H305 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDIP1Q9H305 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDIP1Q9H305 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms