Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAPERQ9BY12 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAPERQ9BY12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
SCAPERQ9BY12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SCAPERQ9BY12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SCAPERQ9BY12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms