Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf48Q96LS8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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