Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC16BQ96JE7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms