Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM12Q96EX1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM12Q96EX1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM12Q96EX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms