Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIRT1Q96EB6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SIRT1Q96EB6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SIRT1Q96EB6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms