Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWCEQ96DN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 902 ms