Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF7Q92985 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF7Q92985 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRF7Q92985 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF7Q92985 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF7Q92985 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF7Q92985 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF7Q92985 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF7Q92985 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF7Q92985 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF7Q92985 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF7Q92985 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms