Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC2Q92769 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC2Q92769 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC2Q92769 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms