Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF19Q5T6S3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF19Q5T6S3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF19Q5T6S3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms