Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FSCN1Q16658 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FSCN1Q16658 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSCN1Q16658 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN1Q16658 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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