Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
JMJD1CQ15652 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
JMJD1CQ15652 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
JMJD1CQ15652 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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