Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKG1Q13976 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKG1Q13976 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKG1Q13976 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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