Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3Q13114 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3Q13114 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms