Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
ARID5AQ03989 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID5AQ03989 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms