Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPM4P67936 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TPM4P67936 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TPM4P67936 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM4P67936 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM4P67936 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM4P67936 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM4P67936 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM4P67936 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPM4P67936 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPM4P67936 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPM4P67936 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPM4P67936 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPM4P67936 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPM4P67936 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPM4P67936 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPM4P67936 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPM4P67936 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPM4P67936 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TPM4P67936 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM4P67936 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM4P67936 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM4P67936 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM4P67936 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM4P67936 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM4P67936 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPM4P67936 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM4P67936 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM4P67936 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM4P67936 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM4P67936 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM4P67936 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPM4P67936 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPM4P67936 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPM4P67936 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM4P67936 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM4P67936 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM4P67936 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM4P67936 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM4P67936 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPM4P67936 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM4P67936 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM4P67936 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM4P67936 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPM4P67936 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TPM4P67936 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TPM4P67936 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM4P67936 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM4P67936 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM4P67936 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM4P67936 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM4P67936 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM4P67936 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM4P67936 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPM4P67936 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM4P67936 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM4P67936 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM4P67936 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM4P67936 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPM4P67936 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms