Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ERVK-16P61578 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-16P61578 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-16P61578 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms