Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00315P59091 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00315P59091 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms