Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00205P59089 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC00205P59089 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms