Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNA8P32881 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNA8P32881 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms