Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A1P19634 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms