Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RPN1P04843 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPN1P04843 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPN1P04843 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPN1P04843 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPN1P04843 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPN1P04843 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPN1P04843 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPN1P04843 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPN1P04843 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPN1P04843 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPN1P04843 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPN1P04843 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPN1P04843 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPN1P04843 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPN1P04843 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPN1P04843 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPN1P04843 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPN1P04843 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPN1P04843 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPN1P04843 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPN1P04843 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPN1P04843 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RPN1P04843 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPN1P04843 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RPN1P04843 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPN1P04843 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPN1P04843 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPN1P04843 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPN1P04843 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPN1P04843 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPN1P04843 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPN1P04843 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPN1P04843 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPN1P04843 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPN1P04843 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPN1P04843 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPN1P04843 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPN1P04843 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPN1P04843 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPN1P04843 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPN1P04843 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPN1P04843 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPN1P04843 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPN1P04843 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPN1P04843 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPN1P04843 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPN1P04843 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPN1P04843 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPN1P04843 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPN1P04843 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPN1P04843 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPN1P04843 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RPN1P04843 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPN1P04843 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPN1P04843 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPN1P04843 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPN1P04843 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPN1P04843 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPN1P04843 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPN1P04843 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPN1P04843 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPN1P04843 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RPN1P04843 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPN1P04843 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPN1P04843 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPN1P04843 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPN1P04843 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPN1P04843 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPN1P04843 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPN1P04843 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPN1P04843 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPN1P04843 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPN1P04843 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPN1P04843 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPN1P04843 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPN1P04843 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPN1P04843 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPN1P04843 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPN1P04843 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RPN1P04843 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPN1P04843 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms