Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC2O95347 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC2O95347 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC2O95347 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC2O95347 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC2O95347 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC2O95347 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC2O95347 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC2O95347 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC2O95347 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC2O95347 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC2O95347 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC2O95347 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC2O95347 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC2O95347 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC2O95347 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC2O95347 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC2O95347 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC2O95347 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC2O95347 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC2O95347 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC2O95347 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC2O95347 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC2O95347 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC2O95347 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC2O95347 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC2O95347 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC2O95347 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC2O95347 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC2O95347 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC2O95347 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC2O95347 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC2O95347 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC2O95347 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC2O95347 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC2O95347 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC2O95347 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC2O95347 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC2O95347 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC2O95347 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC2O95347 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC2O95347 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC2O95347 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC2O95347 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC2O95347 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC2O95347 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC2O95347 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC2O95347 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC2O95347 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC2O95347 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC2O95347 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC2O95347 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC2O95347 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC2O95347 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC2O95347 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC2O95347 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC2O95347 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC2O95347 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC2O95347 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC2O95347 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC2O95347 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC2O95347 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms